Podczas projektowania systemu przewidziano różne grupy użytkowników: od analityków nie posiadających wiedzy geoinformatycznej po zaawansowanych programistów. W zależności od poziomu umiejętności, użytkownicy korzystają z różnych metod dostępu do systemu i innych funkcji (w tym innego modelu pracy w chmurze).
Użytkownicy mogą prowadzić prace samodzielnie, jak również zlecać je pracownikom centrum lub innym zainteresowanym użytkownikom Platformy. Infrastruktura zasadniczo przeznaczona jest do prowadzenia badań i eksperymentów we współpracy nauki z przemysłem. Podstawowy zakres merytoryczny prac badawczo-rozwojowych, które powinna wspierać Platforma CENAGIS obejmuje: